Cosimo I de’ Medici förvärvade 1549 det då ofullbordade Palazzo Pitti och landområdena däromkring. Samma år ritade Niccolò Tribolo trädgårdsanläggningens centralaxel med den hästskoformade amfiteatern. 1583–93 utfördes La Grotta Grande, den mest magnifika grottan från perioden.