Calakmul hade sin storhetstid under mayakulturens klassiska period (250–900) och var huvudort i en centralstyrd stat med skattepliktiga orter omgivande stadskärnan, såsom La Muñeca och Oxpemul. Vid sidan av Tikal, Copán, Palenque och Yaxchilán anses Calakmul haft en dominerande roll över andra stadsstater i mayaområdet under den klassiska perioden.