Kelly deltog som vapeninspektör i Irak på FN:s uppdrag 1994–99. Han var knuten till försvarsdepartementet som expert på biologisk krigföring men uttalade anonymt kritik mot de uppgifter om massförstörelsevapen som den brittiska regeringen använde som förevändning för att stödja USA:s angrepp mot Irak. Kelly begick självmord sedan hans källskydd röjts.