Djuphavsfaunan indelas i batyal fauna och abyssal fauna, vilka återfinns på sluttningarna från kontinentalsockeln respektive på de stora vida slätterna nedanför kontinentalsluttningarna. Ibland har man urskilt ett tredje faunaelement, den hadala faunan, som lever i djuphavsgravarna. Den kan dock inkluderas i den abyssala faunan.