Befattningen var i början av 1600-talet en civil skrivartjänst vid Stockholms örlogsvarv. Efter flyttningen av flottans huvudvarv till Karlskrona 1680 utvecklades tjänsten till en amiralsbefattning med ansvar för all verksamhet på varvet med undantag för artilleritjänsten. Då segelfartygsepoken var slut begränsades ekipagemästarens uppgifter. Numera omfattar ekipagetjänsten förtöjning, transporter, säkerhetstjänst m.m.