Som stenhuggare, skulptör och slutligen som assisterande arkitekt biträdde han sin äldre släkting Carlo Maderno vid uppförandet av bl.a. Peterskyrkan och Sant’Andrea della Valle. Borromini arbetade under Lorenzo Bernini med Palazzo Barberini och med Baldakinen i Peterskyrkan, men på 1630-talet sökte han egna uppdrag och såg sig då som Berninis