I denna omvandlas glukos-6-fosfat till pentosen ribos-5-fosfat. I det av glukos-6-fosfatdehydrogenas katalyserade steget bildas det reducerade koenzymet NADPH (nikotinamid-adenin-dinukleotidfosfat), som är viktigt för att åstadkomma reduktiva biosyntetiska reaktioner i cellen. I vissa områden i världen (Afrika, södra Europa och USA m.fl.) är ärftligt betingad brist på glukos-6-fosfatdehydrogenas en vanlig orsak till hemolytisk anemi,