Spyri är mest känd för böckerna om Heidi, den första med titeln Heidis Lehr- und Wanderjahre (1880; ”Heidi”). De utpräglat religiösa och moraliska Heidiböckerna har fascinerat flera generationers barn och utkommit i stora upplagor och många översättningar samt blivit föremål för en rad filmatiseringar.