När fagens arvsmassa införlivats med bakteriens arvsmassa på detta sätt kallas den profag. Vid lysogeni förökas inte bakteriofagen (vilket är det normala när en bakterie infekteras med en bakteriofag), utan i stället etableras ett ”tyst” tillstånd efter insmältning av fag-DNA i bakteriens arvsmassa. Detta tysta tillstånd kan hävas (aktivering),