Mývatn, som avvattnas av Laxá, ligger 278 m ö.h. i ett vulkaniskt mycket aktivt område med egenartade lavaformationer och många vulkankratrar i och strax intill sjön. Medeldjupet är ca 2,5 m och det största kända ca 7 m. Mývatn har ett rikt fågelliv. Ur sjön utvinns diatomit.