Bagges viktigaste insats var hans vetenskapsteoretiska ställningstaganden, närmast präglade av historismen. Han opponerade kraftfullt mot den positivism som utvecklats av Erik Arup och var en uttalad anhängare av en relativistisk vetenskapsuppfattning. Bagges historieteoretiska huvudarbete är Historiesyn og historieforskning (Mennesket i tiden 8, 1952).