Vid sidan av en framgångsrik teaterkarriär har Waterston gjort komplexa och utmanande filmroller, t.ex. i ”Heaven’s Gate” (1980), ”Dödens fält” (1984), ”The Commission” (2003) och ”En kvinna bland män” (2018), och spelat i flera Woody Allen-filmer, från ”Interiors” (1978) till ”Små och stora brott” (1989).