Samkhya har troligen till vissa delar sina rötter i den förariska kulturen i Indien och utvecklades till en systematisk filosofi århundradena närmast e.Kr., främst genom en lärotext av den legendariske filosofen Kapila. Även Bhagavadgita innehåller tankegångar från samkhya. Det klassiska systemet knöts efterhand som dogmatiskt underlag till yogafilosofin.