Skeppet, som ursprungligen hette Marigalante, hade väderdäck, tre master, uppbyggt förskepp och akterskepp och var med sin längd om 36 m nära dubbelt så stort som de medföljande skeppen Niña och Pinta. Santa María seglade väl under utresan och de första månaderna efter framkomsten. Hon förlorades genom grundstötning utanför Hispaniola på