Cray var en av de ingenjörer som 1957 lämnade Sperry Rand för att bilda Control Data Corporation och var huvudkonstruktör för CDC 1604, en av de första transistorbaserade datorerna (1958). År 1968 presenterades CDC 6600, utvecklad av Cray vid laboratoriet i Chippewa Falls, Wisconsin. Den var då världens mest kraftfulla