Sjöpolisen utför även traditionellt polisarbete längs kusten och i skärgårdar, t.ex. ordningshållning, anmälningsupptagning och utredning samt spaning efter försvunna personer och båtar. Sjöpolisen opererar i vissa kust- och skärgårdsområden samt i Mälaren och Vänern. Viss verksamhet bedrivs i samarbete med bl.a Kustbevakningen.