Michaëlis debuterade med frodig och festlig lyrik på 1890-talet. Samtidigt utvecklade han en stor produktivitet som prosaförfattare med romaner som Giovanna (1901) och Hellener og Barbar (1914). Berömda är också Michaëlis dikter till bilder i Vilhelm Hammershøi (1918) och det flera gånger filmatiserade dramat Revolutions-Bryllup (1906).