Sällskapets viktigaste uppgift är att verka för läkarnas vetenskapliga och kliniska utbildning. SLS deltar aktivt i arbetet på att förbättra kvaliteten i hälso- och sjukvården och är en remissinstans för regering, riksdag och ämbetsverk. Sällskapet förfogar över fonder vilkas avkastning används för att stödja medicinsk forskning.