Vid Vetenskapsrådet finns tre ämnesråd, ett råd och fem kommittéer som fördelar forskningsstöd inom respektive ämnesområden. Det är ämnesråden för humaniora och samhällsvetenskap, för medicin och hälsa, för naturvetenskap och teknikvetenskap, rådet för forskningens infrastrukturer samt kommittérna för klinisk behandlingsforskning, för kliniska studier, för konstnärlig forskning, för utvecklingsforskning och utbildningsvetenskapliga kommittén.