Trädgården anlades av sällskapet 1856 på den Bergmanska åkern och hade betoning på undervisning. Planen i s.k. tysk stil upprättades av den dåvarande örtagårdsmästaren i Uppsala, Daniel Müller (1812–57). Redan 1858 innehöll trädgården nära 900 olika arter träd och buskar och mer än 200 perenner. Trädgården gynnas av kalkgrunden och