Pisksvampar lever huvudsakligen i vatten eller jord. Fortplantningskropparna rör sig med hjälp av en flagell; övriga egentliga svampar saknar flagellstadier. Pisksvampar är nedbrytare eller parasiter på djur. En art (Batrachochyʹtrium dendrobaʹtidis), som växer på grodors skinn, hotar att utrota en mängd grodarter.