Effekten av muskarin liknar den hos ett kroppseget ämne, acetylkolin, genom att det binds till vissa receptorer för acetylkolin i det autonoma nervsystemet. Dock bryts inte muskarin ned lika fort som acetylkolin; effekten blir kraftigare och mera ihållande, vilket förklarar giftverkan. Denna kännetecknas bl.a. av försvårad andning, blodtrycksfall, buksmärtor och