Hit räknas vanligen de två nu levande ordningarna uddatåiga hovdjur och partåiga hovdjur (se tabell) samt sju utdöda ordningar (se nedan). Valar hör utvecklingshistoriskt också till hovdjuren, men de brukar på grund av sitt avvikande utseende och levnadssätt inte räknas dit. Därför är hovdjur inte att betrakta som en systematisk enhet utan