Under sin tid som inrikesminister var Harun chef för den avdelning som koordinerade insatserna, inklusive de militära, mot upproret i Darfur. Han organiserade arbetet med att rekrytera, finansiera och beväpna janjawidmilisen, som anklagats för omfattande och systematiska övergrepp på Darfurs civilbefolkning. Åklagaren anser att Harun varit medveten om att milisen