Elias Wesséns tidigaste arbeten behandlade problem inom formläran i germanska språk, ortnamnsforskning och fornnordisk religion. Han utgav delar av verket ”Sveriges runinskrifter”, editioner av medeltidstexter och, tillsammans med Åke Holmbäck, en översättning av de svenska landskapslagarna (med kommentar). Han publicerade flera översiktsverk, bland annat Svensk språkhistoria i tre delar: