Huvudsakligen används röntgendiffraktion men i speciella fall även neutron- och elektrondiffraktion. Proteinkristallografi spelar en viktig roll inom bl.a. enzymologi, immunologi, cellbiologi, bioteknik och farmakologi där frågor som rör makromolekylers struktur och funktion är väsentliga. Utgående från molekylstrukturen kan hypoteser om molekylens funktionssätt testas med hjälp av riktade mutationer. Man kan